cancel
Showing results for 
Show  only  | Search instead for 
Did you mean: 
JMP is taking Discovery online, April 16 and 18. Register today and join us for interactive sessions featuring popular presentation topics, networking, and discussions with the experts.
Choose Language Hide Translation Bar
JSL을 활용한 PLA (Parallel Line Assays) 분석 자동화

이전 Post(JMP를 활용한 Biological Assays - 개념 및 PLA(Parallel Line Assay) 분석방법)를 통해 BioAssay 분석방법의 개념 및 JMP에서의 분석법을 간단히 살펴보았습니다.

이번 Post에서는 JMP를 활용한 BioAssay 분석법을 JSL(JMP Scripting Language)을 이용하여 자동화(정확히는 반자동화 : Semi-Automating)하는 방법에 대해 공유하고자 합니다.

 

JMP Journal 기능을 이용, Data Table이 주어졌을 때 Test for Regression / Test for Parallelism / Test for Linearity( Post에서는 다루지 않습니다) / Relative Potency 산출 및 95% 신뢰구간 산출을 스크립트를 이용하여 반자동화하였습니다.

 

먼저, 유럽 약전 EP 5.3의 사례 5.1.1 Data Table에서 Preparation U를 제외한 두개의 Preparation(S / T)만으로 분석한다고 가정한 경우입니다.

 

그림1.png

 

위 화면이 최종적으로 만든 JMP Journal이며, 다음과 같은 순서로 분석자동화를 수행하게 됩니다.

 

DaeYun_Kim_1-1580453958961.jpeg

 

① Data Table 준비 : 본 posting에서는 두개의 preparation 만 사용합니다. 첫번째 버튼을 누르면 아래와 같이 Data Table이 준비된 것을 확인할 수 있습니다.
물론 아래의 경우엔 이미 open 되어 있는 자료이며, 다음 단계의 스크립트를 적용하기 위해선 동일한 format data table이 필요합니다.
또한, 이 데이터 테이블은 최종 5단계까지 닫아서는 안 됩니다.

DaeYun_Kim_0-1580455205995.jpeg

 

② PLA (Parallel Line Assays) 를 위한 첫번째 Test for Regression


Journal에 있는 “Test for Regression” 버튼을 누르면 아래와 같이 각 제제(Preparation) 별 기울기가 의미있는 지에 대한 통계적 검정을 실시합니다.
DaeYun_Kim_3-1580453958996.jpeg

 

또한, 非 통계전공자의 경우 위 분석결과 해석이 어려울 수 있는 관계로, 그 다음 버튼인 “View Test Result” 를 누르면 아래와 같이 Test 결과(Passed / Failed)를 출력하게끔 되어 있습니다.

 
 
 
 
 

DaeYun_Kim_0-1580455592954.jpeg

 

③ PLA (Parallel Line Assays) 를 위한 두번째 Test for Parallelism


②번과 마찬가지로 Journal에 있는 “Test for Parallelism” 버튼을 누르면 아래와 같이 두 제제(Preparation)의 기울기가 평행한 지에 대한 통계적 검정을 실시합니다.

DaeYun_Kim_5-1580453959011.jpeg

非 통계전공자를 위한 “View Test Result” 버튼을 통해 아래와 같이 Test 결과(Passed / Failed)를 출력하게끔 되어 있습니다.
DaeYun_Kim_6-1580453959013.jpeg

 

④ Relative Potency와 95% 신뢰구간 구하는 방법

 

"Relative Potency & Confidence Interval" 버튼을 누르면 아래와 같은 결과창이 출력됩니다.

 

re.png

 

⑤ 위 모든 결과를 하나의 화면으로 만드는 버튼이 두개의 “Generating Report” / “Export Final Report as PDF” 버튼입니다.


첫번째 “Generating Report” 버튼을 누르면 한눈에 보기 좋게 각 세 개(Regression / Parallelism / Relative Potency) 결과를 가로로 병합하여 아래와 같은 결과를 보여줍니다.

DaeYun_Kim_1-1580455617438.jpeg

 

 

 

두번째 “Export Final Report as PDF” 버튼은 모든 결과를 reporting 하는 목적으로 pdf 파일로 만드는 스크립트입니다. 이 결과는 출력이 용이하도록 세로로 모든 결과를 병합하였습니다.

DaeYun_Kim_2-1580455629607.jpeg

DaeYun_Kim_3-1580455654361.jpeg

 

위와 같이 세로로 병합된 최종 pdf 파일은 본 post에 첨부하여 드립니다. 참고하시기 바랍니다.

DaeYun_Kim_11-1580453959096.jpeg

 



 
Last Modified: Mar 3, 2024 8:36 AM